Sign Gene dà il via alla prima generazione di supereroi sordi, mutanti che possono creare superpoteri attraverso luso della Lingua dei Segni. Protagonista è Tom Clerc, sordo proveniente da una multigenerazionale famiglia di sordi e discendente di Laurent Clerc, celebre scienziato francese che portò la Lingua dei Segni negli Stati Uniti quasi due secoli fa. Tom è portatore di SGx29, una potente mutazione di Sign Gene e lavora per la Q.I.A. (QuinPar Intelligence Agency) a New York City: una società segreta affiliata al Pentagono, composta da agenti mutanti selezionati. Tom può dotarsi di superpoteri solo tramite luso della Lingua dei Segni. Durante una violenta lotta contro unorganizzazione dedicata allo sterminio di mutanti portatori di Sign Gene, la 1.8.8.0., guidata dal più acerrimo nemico, Jux Clerc, fratello di Tom, questultimo perde tutti i suoi poteri. Hugh Denison, il capo della Q.I.A. invia Tom e il suo collega Ken Wong, in missione speciale a Osaka per indagare su diversi crimini compiuti da mutanti sordi giapponesi ed è proprio in questultima azione contro questa gang che scopre che i suoi poteri non sono del tutto persi.